Wie alle anderen Lebewesen haben auch Bienen ihre eigenen artspezifischen Verhaltensweisen, die für Evolutionisten viele Fragen aufwerfen. Zum Beispiel ist für die unfassbar komplexen Kalkulationen, welche Bienen zum Aufbau der Honigwaben anstellen, eine Erklärung durch Evolutionsmechanismen unmöglich. Auch Charles Darwin war gezwungen zuzugeben, dass seine Theorie das Verhalten von Bienen nicht erklären konnte. In seinem Buch Der Ursprung der Arten betonte Darwin das Dilemma seiner Theorie über den Ursprung von Lebewesen: "Da die natürliche Selektion nur durch die Anhäufung von leichten Änderungen in Struktur oder Instinkt funktioniert, die für jedes Individuum unter seinen jeweiligen Lebensbedingungen nutzbringend sind, so muss man sich logischerweise fragen, wie eine lange und allmähliche Abfolge von veränderten architektonischen Instinkten, die alle zu dem derzeitigen perfekten Konstruktionsplan hintendierten, den Vorfahren der Honigbiene nutzbar gewesen sind." (Charles Darwin, Der Ursprung der Arten, S. 186)